RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472292.1

IL1RN-208, Transcript of interleukin 1 receptor antagonist, human

TSL 1 (best)

Gene IL1RN, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL1RN-208	ENST00000472292	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292		H7C1H1	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	CCL20	P78556	96 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	COX19	Q49B96	90 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	C20orf202	A1L168	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	PHOX2A	O14813	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	CACNG7	P62955	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	CCL25	O15444	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	PDE6D	O43924	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	IFNA1	P01562	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	BCL2	P10415	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	S100A2	P29034	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	AMT	P48728	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	COX6A2	Q02221	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	PEA15	Q15121	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292		F2Z2F3	143 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	UBE2L6	O14933	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	NTF3	P20783	257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IL1RN-208	ENST00000472292	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292		K7ERU9	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	CTRL	P40313	264 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	GNG4	P50150	75 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	VAMP3	Q15836	100 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	STPG4	Q8N801	248 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	LPA	P08519	4548 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292		A0A096LNI7	61 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	FOXI1	Q12951	378 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	TWIST1	Q15672	202 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292		A0A0J9YXV3	536 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292		K7EN84	100 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	NCR2	O95944	276 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	FGF6	P10767	208 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.5	□□□□□ -1.69
IL1RN-208	ENST00000472292	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69

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