RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469653.5

SEMA4D-215, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

TSL 2

Gene SEMA4D, Length 3,533 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SEMA4D-215ENST00000469653 A0A087WW49 117 aa7.33□□□□□ -1.24
SEMA4D-215ENST00000469653 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.33□□□□□ -1.24
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SEMA4D-215ENST00000469653 FAM231AP0DMU4 169 aa7.33□□□□□ -1.24
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