RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H2BJP06899 126 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H2BOP23527 126 aa6.88□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H2BDP58876 126 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 RAB5BP61020 215 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H2BCP62807 126 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 FAM104AQ969W3 186 aa6.88□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.88□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.87□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 TOMM6Q96B49 74 aa6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.87□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 REG3AQ06141 175 aa6.86□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 C6orf223Q8N319 242 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 Q9HAA7 133 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 KMT2AQ03164 3969 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 IGIPA6NJ69 53 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 SERF1AO75920 110 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 CRPP02741 224 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 PMCHL1Q16048 86 aa6.85□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 RTL8CO15255 209 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 NUPR1O60356 82 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 HBDP02042 147 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 MIAQ16674 131 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-211ENST00000460176 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 NFE4Q86UQ8 179 aa6.84□□□□□ -1.31
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GARNL3-211ENST00000460176 NPSP0C0P6 89 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 TIMM17AQ99595 171 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.82□□□□□ -1.32
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GARNL3-211ENST00000460176 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM141Q96I45 108 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 RYR2Q92736 4967 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 RMI2Q96E14 147 aa6.81□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 AMELXQ99217 191 aa6.81□□□□□ -1.32
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GARNL3-211ENST00000460176 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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GARNL3-211ENST00000460176 Q6ZN92 141 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 BAALCQ8WXS3 180 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 VCX2Q9H322 139 aa6.8□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 CCL25O15444 150 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 ATP5LO75964 103 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 UBE2D1P51668 147 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 SS18Q15532 418 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 COX11Q9Y6N1 276 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 RYR3Q15413 4870 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-211ENST00000460176 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.78□□□□□ -1.32
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