RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457356.8

MSC-AS1-201, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MSC-AS1, Length 4,220 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-201ENST00000457356 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLURP1P55000 103 aa7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 GAS8-AS1O95177 125 aa7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 MGAQ8IWI9 3026 aa7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 LINC01548A6NM66 108 aa7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 NREPQ16612 68 aa7.36□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 NFE4Q86UQ8 179 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 UQCRQO14949 82 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGHV3-33P01772 117 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 TRIAP1O43715 76 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZMAT4Q9H898 229 aa7.35□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 ATRQ13535 2644 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 A0A0U1RQV1 116 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.34□□□□□ -1.23
MSC-AS1-201ENST00000457356 A8MZ25 164 aa7.34□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.34□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.34□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 GYPEP15421 78 aa7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLPIP03973 132 aa7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 MIAQ16674 131 aa7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 Q6YL49 198 aa7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.33□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 NDUFC2O95298 119 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 RNF185Q96GF1 192 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 COX7A2LO14548 114 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 HILS1P60008 231 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.32□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 H3BUA1 57 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 NCR3O14931 201 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 MYCNOSP40205 109 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 Q6ZS46 218 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 NDUFS5O43920 106 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 UBE2BP63146 152 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 CDIP1Q9H305 208 aa7.31□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGLV2-11P01706 119 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 RNF152Q8N8N0 203 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 ITPR3Q14573 2671 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 A6NDX4 124 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 K7EQD1 137 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 A0A087WW49 117 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 FSTL3O95633 263 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 Q6ZSV7 163 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 SCXQ7RTU7 201 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.3□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 AVPP01185 164 aa7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 CCDC140Q96MF4 163 aa7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 A0A0J9YX75 114 aa7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 MED14OSP0DP75 135 aa7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.29□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 UPK3BQ9BT76 320 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 LAMA1P25391 3075 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 DEFB4AO15263 64 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 ENHOQ6UWT2 76 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGHV3-30P01768 117 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 APOC4P55056 127 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.28□□□□□ -1.24
MSC-AS1-201ENST00000457356 PROK1P58294 105 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 LINC00694P0DN24 101 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 AKAP13Q12802 2813 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 LINC01006Q8NI28 216 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.27□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 TMEM223A0PJW6 202 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 NDUFA7O95182 113 aa7.26□□□□□ -1.25
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.26□□□□□ -1.25
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