RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSN1S1P47710 185 aa3.84□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HAMPP81172 84 aa3.84□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q0VG73 95 aa3.84□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DAND5Q8N907 189 aa3.84□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q8NAQ8 132 aa3.84□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.84□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.84□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CELA1Q9UNI1 258 aa3.84□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.84□□□□□ -1.79
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYB5AP00167 134 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1-39P01597 117 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-23P01764 117 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HBDP02042 147 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MT-ATP8P03928 68 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1D-39P04432 117 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRGC1P0CF51 173 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APELAP0DMC3 54 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CBLN1P23435 193 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLGLAQ15195 96 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ORMDL3Q8N138 153 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYYR1Q96J86 154 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EPDR1Q9UM22 224 aa3.83□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A0J9YXY3 114 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H3BUA1 57 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLV2-23P01705 113 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRH1P02810 166 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 T-ENOLP0DO92 83 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNCAP37840 140 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LSM3P62310 102 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TDRG1Q3Y452 100 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF876PQ49A33 203 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CMC2Q9NRP2 79 aa3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F8W1H4 67 aa3.81□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 K7EP34 96 aa3.81□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 K7ERJ3 54 aa3.81□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFB6O95139 128 aa3.81□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FXYD3Q14802 87 aa3.81□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIGYQ3MUY2 71 aa3.81□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 R4GMQ9 66 aa3.81□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.81□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNXBP22105 4242 aa3.81□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PITX3O75364 302 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NMBP08949 121 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC25A4P12235 298 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DIRC1Q969H9 104 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OSTCQ9NRP0 149 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TPRKBQ9Y3C4 175 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A1B0GUV1 79 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C7orf66A4D0T2 115 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFP92A6NM28 416 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SERF1AO75920 110 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FABP4P15090 132 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASIPP42127 132 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q8NBF4 154 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USMG5Q96IX5 58 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 S4R3C0 116 aa3.79□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.78□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.78□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A8MWL6 223 aa3.78□□□□□ -1.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LEPROTO15243 131 aa3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms