RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422596.1

TRDN-203, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 3

Gene TRDN, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-203ENST00000422596 TUBA4BQ9H853 241 aa2.59□□□□□ -1.99
TRDN-203ENST00000422596 SMCO4Q9NRQ5 59 aa2.59□□□□□ -1.99
TRDN-203ENST00000422596 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.59□□□□□ -1.99
TRDN-203ENST00000422596 MUC4Q99102 2169 aa2.59□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 LYSTQ99698 3801 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 NACAE9PAV3 2078 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 TRAV21A0A0B4J279 112 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 A0A0J9YXY3 114 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 H3BVH4 76 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 DLEU1O43261 78 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 ZNF861PO60384 105 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 INSP01308 110 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 PRM2P04554 102 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 TDRG1Q3Y452 100 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 EBLN2Q6P2I7 272 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 C1orf158Q8N1D5 194 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 C11orf72Q8NBR9 251 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 LINC00167Q96N53 147 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 IMMP2LQ96T52 175 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 DNAH5Q8TE73 4624 aa2.58□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 COL7A1Q02388 2944 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 MUC21A0A140T8X8 626 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 TMEM189A5PLL7 270 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 K7EP13 123 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 SPINK4O60575 86 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 GPX1P07203 203 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 SMIM6P0DI80 62 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 TSPOP30536 169 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 CKS1BP61024 79 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 DNLZQ5SXM8 178 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 TMEM136Q6ZRR5 245 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 TMEM101Q96IK0 257 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HIST1H4GQ99525 98 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 XCL2Q9UBD3 114 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 PKIGQ9Y2B9 76 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.57□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 A6NDN8 102 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 A8MWL6 223 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 F2Z2F3 143 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 K7EIL1 84 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 GNRH2O43555 120 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 CRYGDP07320 174 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 ASIPP42127 132 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 RPS20P60866 119 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 RAB5BP61020 215 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 CACNG7P62955 275 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HBBP68871 147 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 DEFB135Q30KP9 77 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 LYZL1Q6UWQ5 148 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 FRZBQ92765 325 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 RNF185Q96GF1 192 aa2.56□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 A0A0U1RQV1 116 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 A0A1B0GUT8 65 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 M0R381 172 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 RTL8CO15255 209 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HIST1H2BKO60814 126 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 NCR2O95944 276 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HLA-DQA1P01909 254 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 TRGC2P03986 189 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HIST1H2BJP06899 126 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HIST1H2BOP23527 126 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HIST1H2BBP33778 126 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 PFN2P35080 140 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 RPS10P46783 165 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HIST1H2BDP58876 126 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 LINC00315P59091 139 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HIST1H2BCP62807 126 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HIST2H2BEQ16778 126 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 RASL11AQ6T310 242 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 ZNF493Q6ZR52 646 aa2.55□□□□□ -2
TRDN-203ENST00000422596 AMN1Q8IY45 258 aa2.55□□□□□ -2
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