RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 OVOL1O14753 267 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 ATRQ13535 2644 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM223A0PJW6 202 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 LINC01619G3V211 115 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 hADV29S1A0JD25 119 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 HERVK_113P63121 156 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 A6NDX4 124 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 IGHV3-53P01767 116 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 TIMM17AQ99595 171 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRN-202ENST00000409251 Q9H8V8 135 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRN-202ENST00000409251 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRN-202ENST00000409251 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRN-202ENST00000409251 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRN-202ENST00000409251 MIAQ16674 131 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-202ENST00000409251 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRN-202ENST00000409251 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-202ENST00000409251 A0A087WW49 117 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-202ENST00000409251 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRN-202ENST00000409251 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-202ENST00000409251 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-202ENST00000409251 RNF152Q8N8N0 203 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-202ENST00000409251 LINC01587Q99440 93 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-202ENST00000409251 SLPIP03973 132 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-202ENST00000409251 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-202ENST00000409251 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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PTPRN-202ENST00000409251 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.45□□□□□ -0.9
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PTPRN-202ENST00000409251 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
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PTPRN-202ENST00000409251 LINC00158P58513 81 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRN-202ENST00000409251 DEFB131AP59861 70 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRN-202ENST00000409251 Q6Q795 121 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRN-202ENST00000409251 PEMTQ9UBM1 199 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRN-202ENST00000409251 USMG5Q96IX5 58 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRN-202ENST00000409251 Q6YL49 198 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRN-202ENST00000409251 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.42□□□□□ -0.9
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