RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-202ENST00000398743 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.9□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 A4D1N5 150 aa9.9□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 SPINK8P0C7L1 97 aa9.9□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 UBE2D3P61077 147 aa9.9□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 UBE2D2P62837 147 aa9.9□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 WFDC2Q14508 124 aa9.9□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.9□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 SFTA2Q6UW10 78 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 GAGE12JA6NER3 117 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 TIRAPP58753 221 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 GAGE4Q13068 117 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 GAGE5Q13069 117 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 MTORP42345 2549 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 GAGE7O76087 117 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 GAGE12FP0CL80 117 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 GAGE12GP0CL81 117 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 GAGE12IP0CL82 117 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 PRO0461Q9UI25 63 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 PF4P02776 101 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 LINC00694P0DN24 101 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 MTURNQ8N3F0 131 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 A0A0B4J2C4 111 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 CIDEAO60543 219 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 PSMB2P49721 201 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 LITAFQ99732 161 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 A8MZ25 164 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 HERVK_113P63121 156 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 KRTAP10-3P60369 221 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 ETDBQ3ZM63 59 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 SPANXCQ9NY87 97 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 LY6G6DO95868 133 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 UBE2L6O14933 153 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 COX6A2Q02221 97 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 TMEM101Q96IK0 257 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-202ENST00000398743 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 IGHV3-33P01772 117 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 PRSS2P07478 247 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 ERG28Q9UKR5 140 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 J3QR89 54 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 TCL1BO95988 128 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 MIAQ16674 131 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 TMEM243Q9BU79 118 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 NDUFA1O15239 70 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 HIVEP2P31629 2446 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 TIMM17BO60830 172 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 JMJD1CQ15652 2540 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 H7C2G1 150 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 H7C423 109 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 Q1RN00 199 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 FHL2Q14192 279 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 NPC2P61916 151 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 CRLF1O75462 422 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 IFITM1P13164 125 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 INSL3P51460 131 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 RNF183Q96D59 192 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 Q9H8V8 135 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-202ENST00000398743 INAFM1C9JVW0 142 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-202ENST00000398743 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-202ENST00000398743 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-202ENST00000398743 DEFB130BP0DP73 79 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.7 ms