RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP10-11P60412 298 aa9.2□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 SEC11AP67812 179 aa9.2□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.2□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q8NAQ8 132 aa9.2□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.2□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM223A0PJW6 202 aa9.19□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 A6NDN8 102 aa9.19□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 LEPROTO15243 131 aa9.19□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 TAL2Q16559 108 aa9.19□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.19□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.19□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF815PA8K554 130 aa9.18□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 H3BRM9 83 aa9.18□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP5G1P05496 136 aa9.18□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 GYPEP15421 78 aa9.18□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATRQ13535 2644 aa9.18□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.18□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.18□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.18□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.17□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 PAX4O43316 350 aa9.17□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.17□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.17□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM104AQ969W3 186 aa9.17□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 J3QQQ9 107 aa9.16□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB4AO15263 64 aa9.16□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBE2D1P51668 147 aa9.16□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 TIRAPP58753 221 aa9.16□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.16□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 HERVK_113P63121 156 aa9.15□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.15□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.14□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 GCSHP23434 173 aa9.14□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE6Q13070 117 aa9.14□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.14□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.14□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.14□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 HIST1H4GQ99525 98 aa9.14□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.14□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.13□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 F5H768 121 aa9.13□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 G3V4G9 280 aa9.13□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 CEND1Q8N111 149 aa9.13□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 CELA1Q9UNI1 258 aa9.13□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 COL6A5A8TX70 2615 aa9.13□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 STAB1Q9NY15 2570 aa9.13□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.12□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.12□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.12□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 PTTG1IPP53801 180 aa9.12□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.11□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 MDFIQ99750 246 aa9.11□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 TM2D2Q9BX73 214 aa9.11□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 COX11Q9Y6N1 276 aa9.11□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.11□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.1□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.1□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A0J9YY99 117 aa9.1□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.1□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 A6NJY4 79 aa9.1□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.1□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 HTN3P15516 51 aa9.1□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.1□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 TAX1BP3O14907 124 aa9.09□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPINK8P0C7L1 97 aa9.09□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMIM13P0DJ93 91 aa9.09□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.09□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 RETNQ9HD89 108 aa9.09□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM238C9JI98 176 aa9.08□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.08□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 VWFP04275 2813 aa9.07□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1B0GUV1 79 aa9.07□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM262E9PQX1 116 aa9.07□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 FXYD2P54710 66 aa9.07□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A096LPF7 62 aa9.06□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.06□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 H3BNG1 76 aa9.06□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 C12orf74Q32Q52 190 aa9.06□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPATA25Q9BR10 227 aa9.06□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.06□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCL25O15444 150 aa9.05□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 COX6A2Q02221 97 aa9.05□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.05□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.04□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.04□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A0J9YXY3 114 aa9.04□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 C9orf118A6NHY6 69 aa9.04□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 RBX1P62877 108 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms