RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 BAALCQ8WXS3 180 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GUV1 79 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 SCGB1D1O95968 90 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 RBX1P62877 108 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 MPV17L2Q567V2 206 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZUT4 128 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-30P01768 117 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-33P01772 117 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 Q8N976 141 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 SIVA1O15304 175 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 CRPP02741 224 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 TENM3Q9P273 2699 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 F8VRH5 84 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 C3orf84H3BNL1 204 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 SEC11AP67812 179 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 AMELXQ99217 191 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 UPK3BQ9BT76 320 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 CST9LQ9H4G1 147 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 PLNP26678 52 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 SS18Q15532 418 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01545Q5VT33 79 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 KLK12Q9UKR0 248 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 DPM2O94777 84 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 IGKCP01834 107 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 REG3AQ06141 175 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 ODF1Q14990 250 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 Q9H8V8 135 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0J9YXV3 536 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 CCL25O15444 150 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM6P0DI80 62 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2D1P51668 147 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 CASC10Q5T4H9 136 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 Q8N3U1 123 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2WQ96B02 151 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 K7EP13 123 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 HERVK_113P63121 156 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 S100A12P80511 92 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 PYY3Q5JQD4 70 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 ATOH7Q8N100 152 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 FAM104AQ969W3 186 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 IGLC3P0DOY3 106 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 HERVK_113P61574 105 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRK-201ENST00000368202 C11orf86A6NJI1 115 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 H3BRM9 83 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRK-201ENST00000368202 TTC32Q5I0X7 151 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRK-201ENST00000368202 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRK-201ENST00000368202 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 XCL1P47992 114 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 ENHOQ6UWT2 76 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 RMI2Q96E14 147 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRK-201ENST00000368202 LY6G6CO95867 125 aa8.24□□□□□ -1.09
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