RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 H7C1H1 209 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 PFDN1O60925 122 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 LTAP01374 205 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 ANGP03950 147 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 CXCL1P09341 107 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 KRTAP10-10P60014 251 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF726P1Q15940 193 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 LINC01620Q4KN68 170 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 C15orf54Q8N8G6 183 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 GTSF1Q8WW33 167 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 BATF3Q9NR55 127 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 UMAD1C9J7I0 102 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 HLA-DQA1P01909 254 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 OR5AL1P0C617 328 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 RPL19P84098 196 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 Q5BKY6 102 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 ENHOQ6UWT2 76 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 BAGE2Q86Y30 109 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 DPH3Q96FX2 82 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 DNAJC30Q96LL9 226 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 AP1S3Q96PC3 154 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 DERL1Q9BUN8 251 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 VAX2Q9UIW0 290 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 A0A0D9SG52 128 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 XKRY2A2RUG3 117 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 TEX46H3BTG2 121 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 ARPC5O15511 151 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 P01737 135 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 GZMBP10144 247 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 RPS20P60866 119 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 SSTP61278 116 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 MPV17L2Q567V2 206 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 KCNRGQ8N5I3 272 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 FAM213BQ8TBF2 198 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 MBD3L1Q8WWY6 194 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 F2Z2F3 143 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 UBE2L6O14933 153 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 SNAI2O43623 268 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 RBX1P62877 108 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 CACNG7P62955 275 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 REG3AQ06141 175 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 IQCJQ1A5X6 159 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 RNF185Q96GF1 192 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM243Q9BU79 118 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 TPPP3Q9BW30 176 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 MANBALQ9NQG1 85 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 BIN3Q9NQY0 253 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 MUC21A0A140T8X8 626 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1B0GV50 99 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 HMSDA8MTL9 139 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 M0QY20 66 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 IFNA1P01562 189 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 MGPP08493 103 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 TRGC1P0CF51 173 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 GNG4P50150 75 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 RAB5CP51148 216 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF345Q14585 488 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 RGS21Q2M5E4 152 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 RASL11AQ6T310 242 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 CLPSL2Q6UWE3 100 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 Q6ZRU5 148 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 Q6ZVQ6 151 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 OR2D3Q8NGH3 330 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 C7orf33Q8WU49 177 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 PDE6DO43924 150 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 SULT1A2P50226 295 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 COTL1Q14019 142 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 SMIM12Q96EX1 92 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-204ENST00000367379 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms