RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 F8WEM9 126 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 COX7A2LO14548 114 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDE6HQ13956 83 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N2B8 174 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPG11Q96JI7 2443 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 PAX4O43316 350 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 RMI2Q96E14 147 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP6V0E1O15342 81 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR9Q5T870 116 aa7.93□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.92□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.92□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPBQ8NG41 125 aa7.92□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0J9YXV3 536 aa7.92□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAA4P35542 130 aa7.92□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 MIAQ16674 131 aa7.92□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.92□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.92□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.92□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.91□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.91□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0J9YX75 114 aa7.9□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM141Q96I45 108 aa7.9□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.9□□□□□ -1.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 F6UB75 175 aa7.9□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N9W7 124 aa7.9□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC140Q96MF4 163 aa7.9□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF5Q99942 180 aa7.9□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 ODF3BA8MYP8 253 aa7.89□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.89□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.89□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.89□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 SORL1Q92673 2214 aa7.89□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.89□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIMM17AQ99595 171 aa7.89□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1W2PPR1 153 aa7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 ENHOQ6UWT2 76 aa7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 GPHB5Q86YW7 130 aa7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 COPS9Q8WXC6 57 aa7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-11P01762 117 aa7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.87□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.87□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR15Q8IV56 129 aa7.87□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.87□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A087WZ39 114 aa7.86□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.86□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.86□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZRU5 148 aa7.86□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N6K4 173 aa7.86□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.86□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.86□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.86□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 GNRH2O43555 120 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLKP1Q107X0 134 aa7.85□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 LY6EQ16553 131 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 NCR3O14931 201 aa7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.84□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A087WWL8 130 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 F5H697 171 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 DAD1P61803 113 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 C6orf223Q8N319 242 aa7.83□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 CREBBPQ92793 2442 aa7.82□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.82□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 VCYO14598 125 aa7.82□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV3-20P01619 116 aa7.82□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFHR3Q02985 330 aa7.82□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.82□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BS24 57 aa7.82□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP1R17O96001 155 aa7.81□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 BLCAPP62952 87 aa7.81□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.81□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.81□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 VPREB1P12018 145 aa7.81□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUC4Q99102 2169 aa7.81□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 CENPEQ02224 2701 aa7.8□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 SOCS3O14543 225 aa7.8□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.8□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.8□□□□□ -1.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms