RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356537.8

CCDC25-201, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC25, Length 3,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-201ENST00000356537 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 FHL2Q14192 279 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 GAGE12JA6NER3 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 IGHV3-30P01768 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 SMIM13P0DJ93 91 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 GAGE4Q13068 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 GAGE5Q13069 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 COTL1Q14019 142 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 GAGE13Q4V321 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 LEPROTO15243 131 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 LITAFQ99732 161 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 IGLL5B9A064 214 aa6.66□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 CRYBA4P53673 196 aa6.66□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 RRN3P1Q2M238 152 aa6.66□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.66□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.66□□□□□ -1.34
CCDC25-201ENST00000356537 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.66□□□□□ -1.34
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CCDC25-201ENST00000356537 HERVK_113P61574 105 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.65□□□□□ -1.35
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CCDC25-201ENST00000356537 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCDC25-201ENST00000356537 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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CCDC25-201ENST00000356537 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 GAGE10A6NGK3 116 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 A0A0J9YXY3 114 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.63□□□□□ -1.35
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CCDC25-201ENST00000356537 CFC1P0CG37 223 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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CCDC25-201ENST00000356537 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.63□□□□□ -1.35
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CCDC25-201ENST00000356537 DEFB135Q30KP9 77 aa6.62□□□□□ -1.35
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CCDC25-201ENST00000356537 TMEM101Q96IK0 257 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.62□□□□□ -1.35
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CCDC25-201ENST00000356537 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.61□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 TIRAPP58753 221 aa6.61□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 CELA1Q9UNI1 258 aa6.61□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 WIPF1O43516 503 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 COL7A1Q02388 2944 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 NOTCH1P46531 2555 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 FABP2P12104 132 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 SFTA2Q6UW10 78 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 A4D1N5 150 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 APOMO95445 188 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 COL6A5A8TX70 2615 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 H3BMG7 143 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 MTURNQ8N3F0 131 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 Q8NAQ8 132 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 PRO0461Q9UI25 63 aa6.59□□□□□ -1.35
CCDC25-201ENST00000356537 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.59□□□□□ -1.36
CCDC25-201ENST00000356537 KRTAP10-11P60412 298 aa6.58□□□□□ -1.36
CCDC25-201ENST00000356537 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.58□□□□□ -1.36
CCDC25-201ENST00000356537 TMEM243Q9BU79 118 aa6.58□□□□□ -1.36
CCDC25-201ENST00000356537 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CCDC25-201ENST00000356537 GAGE6Q13070 117 aa6.58□□□□□ -1.36
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