RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP10-9P60411 292 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 CKS1BP61024 79 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf158Q8N1D5 194 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM101Q96IK0 257 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 HERVK_113P63121 156 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 XCL2Q9UBD3 114 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 COX6CP09669 75 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF462Q96JM2 2506 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 POLQO75417 2590 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00242Q5T6M2 205 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 STHQ8IWL8 128 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 H3BT86 120 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 J3QKU1 62 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 PLA2G2AP14555 144 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 Q6ZSV7 163 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 COX6A2Q02221 97 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 Q96MF0 132 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 K7EQD1 137 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD1-201ENST00000331462 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 LST1O00453 97 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 H7C423 109 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 CITED1Q99966 193 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 TRAV4A0A0B4J268 109 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00694P0DN24 101 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 NPC2P61916 151 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM1B2RUZ4 78 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 UBE2WQ96B02 151 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 TEX29Q8N6K0 151 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00308Q8TCZ7 52 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 Q9H8V8 135 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 C2orf82Q6UX34 121 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 COPS9Q8WXC6 57 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 PPDPFQ9H3Y8 114 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 PTPN13Q12923 2485 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 Q6ZTI0 123 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 DAND5Q8N907 189 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 MYO9AB2RTY4 2548 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 CCL24O00175 119 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 LRRK2Q5S007 2527 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 F5H768 121 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 CLEC2BQ92478 149 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 TEX15Q9BXT5 2789 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFA7O95182 113 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 HERV-K104P63124 156 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD1-201ENST00000331462 PLAC8L1A1L4L8 177 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE12JA6NER3 117 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE4Q13068 117 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE5Q13069 117 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 SHISA2Q6UWI4 295 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 C16orf74Q96GX8 76 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 FAM110AQ9BQ89 295 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 CENPEQ02224 2701 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PRX2 142 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 SNCGO76070 127 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 Q6Q795 121 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 PRIMA1Q86XR5 153 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM243Q9BU79 118 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 COX7A2LO14548 114 aa16■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 ESM1Q9NQ30 184 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 C11orf44Q8N8P7 122 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 FASNP49327 2511 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 ABCA12Q86UK0 2595 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 UBE2L6O14933 153 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE2BQ13066 116 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE2EQ4V326 116 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 MEIG1Q5JSS6 88 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 OVOL2Q9BRP0 275 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms