RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 TMEM223A0PJW6 202 aa10.03□□□□□ -0.8
MSMO1-201ENST00000261507 J3QQQ9 107 aa10.03□□□□□ -0.8
MSMO1-201ENST00000261507 IGHV3-53P01767 116 aa10.03□□□□□ -0.8
MSMO1-201ENST00000261507 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.03□□□□□ -0.8
MSMO1-201ENST00000261507 SFTA2Q6UW10 78 aa10.03□□□□□ -0.8
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF479Q96JC4 524 aa10.03□□□□□ -0.8
MSMO1-201ENST00000261507 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.03□□□□□ -0.8
MSMO1-201ENST00000261507 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa10.02□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 RHODO00212 210 aa10.02□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 RS1O15537 224 aa10.02□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 MTURNQ8N3F0 131 aa10.02□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 LINC00467Q9BRT7 94 aa10.02□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 SPXQ9BT56 116 aa10.02□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 A0A1B0GWB2 263 aa10□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 APOMO95445 188 aa10□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 RRN3P1Q2M238 152 aa10□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 Q6ZTI0 123 aa10□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 RNF183Q96D59 192 aa10□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 TM2D3Q9BRN9 247 aa10□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 SBSPONQ8IVN8 264 aa10□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 H3BMG7 143 aa9.99□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.99□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.99□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.99□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.99□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 Q6ZUT4 128 aa9.99□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 PTH2Q96A98 100 aa9.99□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 K7ERU9 68 aa9.98□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 LEPROTO15243 131 aa9.98□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 IGHV3-30P01768 117 aa9.98□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.98□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.98□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.98□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.98□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.98□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 IL17DQ8TAD2 202 aa9.98□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 UBE2D1P51668 147 aa9.97□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 WFDC2Q14508 124 aa9.97□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 DEFB135Q30KP9 77 aa9.97□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 VPS25Q9BRG1 176 aa9.97□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.96□□□□□ -0.81
MSMO1-201ENST00000261507 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 TSPAN13O95857 204 aa9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 CFC1BP0CG36 223 aa9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 CFC1P0CG37 223 aa9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 LINC00694P0DN24 101 aa9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 MIFP14174 115 aa9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 COTL1Q14019 142 aa9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 SPINK8P0C7L1 97 aa9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 FBN3Q75N90 2809 aa9.95□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.94□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.94□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.94□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 GAGE12JA6NER3 117 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 GAGE4Q13068 117 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 GAGE5Q13069 117 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 GAGE13Q4V321 117 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 A0A0J9YXY3 114 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 GAGE7O76087 117 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 GAGE12FP0CL80 117 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 GAGE12GP0CL81 117 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 GAGE12IP0CL82 117 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 COX6A2Q02221 97 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.93□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.92□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 A4D1N5 150 aa9.92□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 A6NJY4 79 aa9.92□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.92□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 K7EQD1 137 aa9.91□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.91□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.91□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.9□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 C16orf74Q96GX8 76 aa9.9□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 PRO0461Q9UI25 63 aa9.9□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 X6R8D5 127 aa9.9□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.9□□□□□ -0.82
MSMO1-201ENST00000261507 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.9□□□□□ -0.83
MSMO1-201ENST00000261507 PSMB2P49721 201 aa9.9□□□□□ -0.83
MSMO1-201ENST00000261507 NPC2P61916 151 aa9.9□□□□□ -0.83
MSMO1-201ENST00000261507 RETNQ9HD89 108 aa9.9□□□□□ -0.83
MSMO1-201ENST00000261507 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.89□□□□□ -0.83
MSMO1-201ENST00000261507 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms