RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039061.14

Trappc11-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc11, Length 4,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr1189A2AV11 306 aa9.52□□□□□ -0.88
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gfra3O35118 397 aa9.52□□□□□ -0.88
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Icam2P35330 277 aa9.52□□□□□ -0.88
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gpbar1Q80SS6 329 aa9.52□□□□□ -0.88
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Smim19Q80ZU4 107 aa9.52□□□□□ -0.88
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ighv7-4A0A0A6YXL5 121 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tff3Q62395 81 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Wipf2Q6PEV3 440 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pxt1Q8K459 51 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tmem97Q8VD00 176 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Med12lQ8BQM9 2157 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Lbhd2G3UW55 114 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Klf14Q19A41 325 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm10803Q3TZS6 135 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Defa24Q5G865 93 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr16Q62007 309 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gpr35Q9ES90 307 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Zfp36P22893 319 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 SlpiP97430 131 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Slc25a48Q8BW66 306 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Znhit3Q9CQK1 151 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Q9D8L0 127 aa9.52□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cox7a2lQ61387 111 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Wdr82Q8BFQ4 313 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 MturnQ8CGA4 131 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tmem189Q99LQ7 271 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Heatr5aQ5PRF0 2038 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Q3U1D9 316 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Klhdc3Q8VEM9 382 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 1700008P02RikQ9DAJ8 175 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rnf7Q9WTZ1 113 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 P18530 117 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm11232Q5SPI8 295 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr1382Q7TQT3 311 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr984Q8VFN1 314 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr1256Q8VGP1 306 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tmem160Q9D938 188 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mmp17Q9R0S3 578 aa9.51□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm16442D3YZG3 307 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ntf4Q80VU4 209 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Il22ra2Q80XF5 230 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Vstm5Q9D806 199 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ccl2P10148 148 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Neurog3P70661 214 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Prr23a3Q9CWP9 254 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Spcs1Q9D958 161 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tnfrsf13bQ9ET35 249 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tcrg-C2A0A075B5Z2 167 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Igkv14-100A0A0G2JG36 117 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr1185-ps1F6XP16 303 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 P01853 167 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 FasP25446 327 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr491Q8VG06 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr481Q8VGI5 312 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mrps36Q9CQX8 102 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Psmg3Q9CZH3 122 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tmem29A2ANF5 204 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Wdr86D3Z757 380 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tmem241Q3UME2 297 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Snx22Q8C084 192 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Fhl3Q9R059 289 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ramp3Q9WUP1 147 aa9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tet2Q4JK59 1912 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr1192-ps1A0A1L1SRD7 309 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Sh3bgrl2Q8BG73 107 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gatad1Q920S3 266 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tmed6Q9CQG0 239 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm45753A0A1C7CYU8 86 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rpl13aP19253 203 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mrps18cQ8R2L5 143 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 PerpQ9JK95 193 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Piezo2Q8CD54 2822 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tmem116A0A0G2JGD3 401 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Defa3P28310 93 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Defa10P50708 93 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Defa15P50713 93 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Fbln7Q501P1 440 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mex3bQ69Z36 601 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rln3Q8CHK2 141 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr1431Q8VF59 312 aa9.49□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ighv1-26A0A075B5V0 117 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Trbv13-3A0A0B4J1H2 113 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm12253Q5NC48 229 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Dnase2bQ9QY48 354 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cd209gD3Z5D4 194 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Vmn1r1E9PVR6 306 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 TfpiO54819 306 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Slc35d2Q762D5 326 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Il22ra1Q80XZ4 581 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Erg28Q9ERY9 140 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ighv1-16A0A075B5U1 98 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Trbv26A0A0B4J1P5 115 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 GrnP28798 589 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pdlim4P70271 330 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 AgerQ62151 402 aa9.48□□□□□ -0.89
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Fam206aQ80ZQ9 193 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58 ms