RNA–Protein interactions for RNA: YKR062W

TFA2, Transcript of TFIIE small subunit, yeast

Gene TFA2, Length 987 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TFA2	YKR062W	COQ6	P53318	479 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TFA2	YKR062W	CPR8	P53728	308 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TFA2	YKR062W	AAT1	Q01802	451 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TFA2	YKR062W	HIM1	Q06674	414 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TFA2	YKR062W	CRT10	Q08226	957 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TFA2	YKR062W	ULA1	Q12059	462 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TFA2	YKR062W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TFA2	YKR062W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	EMP70	P32802	667 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	APM3	P38153	483 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	IMA5	P40884	581 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	ENT2	Q05785	613 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	AAD4	Q07747	329 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	QRI7	P43122	407 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	MAD3	P47074	515 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	TRS31	Q03337	283 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	USA1	Q03714	838 aa		5.14	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	PIF1	P07271	859 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	SDH8	P38345	138 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	MTG2	P38860	518 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	PAC2	P39937	518 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	OPT1	P40897	799 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	UBX4	P54730	416 aa		5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	PTH2	P34222	208 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	CAB2	P40506	365 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	SAP4	P53036	818 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	COS12	P53053	380 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	SUT2	Q12286	268 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		5.12	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	AAC1	P04710	309 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	POL3	P15436	1097 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	MRPL36	P36531	177 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	SKP2	P42843	763 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	POL31	P46957	487 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	YGL117W	P53133	265 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	ACS1	Q01574	713 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	ATG21	Q02887	496 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	WAR1	Q03631	944 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	GIS1	Q03833	894 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	CRF1	Q04930	467 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	ARO10	Q06408	635 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	AAD3	P25612	363 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	PEX2	P32800	271 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	YHL041W	P38730	149 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	MAM1	P40065	302 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	LAS21	P40367	830 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	YJL043W	P47053	257 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	COG2	P53271	262 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	BNR1	P40450	1375 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	YMC1	P32331	307 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	CDC5	P32562	705 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	SIP1	P32578	815 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	ORC2	P32833	620 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	ORM2	Q06144	216 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TFA2	YKR062W	BI2	P03873	423 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	MSS18	P08593	268 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	SIR1	P21691	654 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	RIT1	P23796	513 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	RPC34	P32910	317 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	ATF1	P40353	525 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	PDE1	P22434	369 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	YCR061W	P25639	631 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	IRC3	Q06683	689 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	PMA2	P19657	947 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	IMO32	P53219	342 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	YNL058C	P53947	316 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	ARG7	Q04728	441 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TFA2	YKR062W	BLS1	Q06071	122 aa		5.06	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.6 ms