RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	YFL015C	P43578	164 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	PIP2	P52960	996 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	COS12	P53053	380 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	WAR1	Q03631	944 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	RIM13	Q03792	727 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	SND1	Q04007	877 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	SEG1	Q04279	960 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	TRI1	Q05024	226 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.48	□□□□□ -1.85	not detected
CSE4	YKL049C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	MDM10	P18409	493 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	NUP1	P20676	1076 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	CDC5	P32562	705 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	RPC34	P32910	317 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	TOM20	P35180	183 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	TAF5	P38129	798 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	YJL043W	P47053	257 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	TGL2	P54857	326 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	CRT10	Q08226	957 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	PCL8	Q08966	492 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.85
CSE4	YKL049C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	ADH4	P10127	382 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	NIC96	P34077	839 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	OPT1	P40897	799 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	IDS2	P46958	469 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	ASK10	P48361	1146 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	PEX8	P53248	589 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	MPD2	Q99316	277 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	YLF2	P38746	405 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	SWD1	P39706	426 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	EXO1	P39875	702 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	VFA1	P40080	203 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	IMA5	P40884	581 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	TRS31	Q03337	283 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	ENT2	Q05785	613 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	ORM2	Q06144	216 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	CTT1	P06115	562 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	APN1	P22936	367 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	MBR1	P23493	339 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	GRX7	P38068	203 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	TDA10	P42938	290 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	POL31	P46957	487 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	YNL092W	P53934	400 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	ACS1	Q01574	713 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	GDA1	P32621	518 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	APD1	P38281	316 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	MTG2	P38860	518 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	LNP1	P38878	278 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	ATP23	P53722	227 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	IRC3	Q06683	689 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	CRD1	Q07560	283 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	ARP7	Q12406	477 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	YCR061W	P25639	631 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	GSY2	P27472	705 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	MAM1	P40065	302 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	LTP1	P40347	161 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	LAS21	P40367	830 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	XBP1	P40489	647 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	YML119W	Q03208	357 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	VPS64	Q03944	604 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	RAD33	Q04231	177 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	AAD4	Q07747	329 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	YOL114C	Q12322	202 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	AMD2	P22580	549 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	YKL133C	P36066	463 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	MAD3	P47074	515 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	COG2	P53271	262 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	UBP16	Q02863	499 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	CRF1	Q04930	467 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	BSP1	Q06604	576 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	AFT2	Q08957	416 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSE4	YKL049C	BI2	P03873	423 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CSE4	YKL049C	PTP1	P25044	335 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CSE4	YKL049C	BEM3	P32873	1128 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CSE4	YKL049C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CSE4	YKL049C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CSE4	YKL049C	RAD26	P40352	1085 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CSE4	YKL049C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CSE4	YKL049C	BST1	P43571	1029 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CSE4	YKL049C	SAE2	P46946	345 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CSE4	YKL049C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CSE4	YKL049C	HRD3	Q05787	833 aa		3.4	□□□□□ -1.87

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