RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		6.65	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		6.65	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	JDP2	Q8WYK2	163 aa		6.65	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		6.65	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	BCO2	Q9BYV7	579 aa		6.65	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		6.65	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SHROOM2	Q13796	1616 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	NID1	P14543	1247 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB33A	Q14088	237 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAM19	Q9H013	955 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	IQGAP2	Q13576	1575 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		6.64	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL12	A8MUP2	240 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	GIPC1	O14908	333 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRA	P18433	802 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	BAG6	P46379	1132 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	MSL1	Q68DK7	614 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		6.63	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC27	P30260	824 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIA4	P48058	902 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	CHMP4BP1	P59074	171 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	ILDR2	Q71H61	639 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	IER2	Q9BTL4	223 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCB6	Q9NP58	842 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A096LPE4	126 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PPZ6	126 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	MSTN	O14793	375 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	GYS2	P54840	703 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	ODR4	Q5SWX8	454 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	LILRB2	Q8N423	598 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	BSND	Q8WZ55	320 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	EVI5L	Q96CN4	794 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SPON2	Q9BUD6	331 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	TMX1	Q9H3N1	280 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SOX13	Q9UN79	622 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	ESYT3	A0FGR9	886 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L7	P0C7H9	530 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	PODN	Q7Z5L7	613 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	APPBP2	Q92624	585 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM11	Q96F44	468 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	MUC3B	Q9H195	1237 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		6.61	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	DISP1	Q96F81	1524 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM177B	A6PVY3	158 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	GNB5	O14775	395 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	EPHA1	P21709	976 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	ITPKA	P23677	461 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	FCGRT	P55899	365 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	RHBDL3	P58872	404 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	ARSH	Q5FYA8	562 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SGSM3	Q96HU1	749 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	PLVAP	Q9BX97	442 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	GINM1	Q9NU53	330 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	PIK3R2	O00459	728 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	CREB3	O43889	395 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	MASP1	P48740	699 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.59	□□□□□ -1.35

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