RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617744.4

NUDT13-208, Transcript of nudix hydrolase 13, human

TSL 5 BASIC

Gene NUDT13, Length 928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUDT13-208	ENST00000617744	GAK	O14976	1311 aa		9.72	□□□□□ -0.85
NUDT13-208	ENST00000617744	AK9	Q5TCS8	1911 aa		9.72	□□□□□ -0.85
NUDT13-208	ENST00000617744	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	RHBDL3	P58872	404 aa		9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SREBF2	Q12772	1141 aa		9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	MAP3K12	Q12852	859 aa		9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	MAP3K11	Q16584	847 aa		9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	HOOK2	Q96ED9	719 aa		9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	9.71	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ENTPD3	O75355	529 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	USP5	P45974	858 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	IDI2	Q9BXS1	227 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	DCTPP1	Q9H773	170 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		9.7	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	CA12	O43570	354 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	CHGB	P05060	677 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	TM4SF4	P48230	202 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	DGKZ	Q13574	1117 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	CCL15	Q16663	113 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PALD1	Q9ULE6	856 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		9.69	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	IRF6	O14896	467 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	IFFO2	Q5TF58	517 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	IFNL1	Q8IU54	200 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		9.68	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PDE6A	P16499	860 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PLCG2	P16885	1265 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ATP5J	P18859	108 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	GTF2A2	P52657	109 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ERO1B	Q86YB8	467 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	GPATCH3	Q96I76	525 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PTPN18	Q99952	460 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ARMT1	Q9H993	441 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PICK1	Q9NRD5	415 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		9.67	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	GPR25	O00155	361 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ZBTB22	O15209	634 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	GDF11	O95390	407 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	INHBE	P58166	350 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PPP4C	P60510	307 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PCNT	O95613	3336 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		9.66	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	FLT1	P17948	1338 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	TRIM75P	A6NK02	468 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PRKAB2	O43741	272 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	ALDH1A1	P00352	501 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	HLA-DOA	P06340	250 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	CETP	P11597	493 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PPAT	Q06203	517 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	CRHR2	Q13324	411 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	PPIL2	Q13356	520 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SNAPC2	Q13487	334 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		9.65	□□□□□ -0.86
NUDT13-208	ENST00000617744	LCORL	Q8N3X6	602 aa		9.65	□□□□□ -0.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms