RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604740.5

LAMA4-222, Transcript of laminin subunit alpha 4, human

TSL 2

Gene LAMA4, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMA4-222	ENST00000604740	LEFTY1	O75610	366 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	NEFM	P07197	916 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	ITGB5	P18084	799 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	NME2	P22392	152 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	ARNT	P27540	789 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	BNIP3	Q12983	259 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	DSC3	Q14574	896 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	SPRED2	Q7Z698	418 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	MISP3	Q96FF7	219 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LAMA4-222	ENST00000604740	TREH	O43280	583 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	BRD1	O95696	1058 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	OGFOD2	Q6N063	350 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	ISL2	Q96A47	359 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740		U3KQE9	123 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	MAPK8	P45983	427 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	GSTT1	P30711	240 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	ERVK-24	P63145	666 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	RNF214	Q8ND24	703 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	CEACAM5	P06731	702 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	CD8B	P10966	210 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	CD96	P40200	585 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	PICK1	Q9NRD5	415 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.3	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	FBXO24	O75426	580 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	PAPLN	O95428	1278 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	ITIH2	P19823	946 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	FUT4	P22083	530 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	PRKCQ	Q04759	706 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	FBF1	Q8TES7	1133 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	VAV3	Q9UKW4	847 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	SAMM50	Q9Y512	469 aa		7.29	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	BIN1	O00499	593 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	ENC1	O14682	589 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	OXCT1	P55809	520 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	AOC3	Q16853	763 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	PPM1J	Q5JR12	505 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	CEP44	Q9C0F1	390 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LAMA4-222	ENST00000604740	PAGE1	O75459	146 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	TRIM37	O94972	964 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	BMP6	P22004	513 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		7.26	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	ATP2B2	Q01814	1243 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		7.25	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	C8A	P07357	584 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	CELA3A	P09093	270 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	NTF4	P34130	210 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	LRRC14	Q15048	493 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.24	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	SPG7	Q9UQ90	795 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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