RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.64■■□□□ 1.05
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF165P49910 485 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZBTB22O15209 634 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STX1AQ16623 288 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 AP5Z1O43299 807 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHD4Q14839 1912 aa21.59■■□□□ 1.05
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM182BQ5T319 152 aa21.59■■□□□ 1.05
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLRK1P26718 216 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDUFA8P51970 172 aa21.57■■□□□ 1.04
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.56■■□□□ 1.04
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADRA2BP18089 450 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNKSO95271 1327 aa21.55■■□□□ 1.04
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 SEC23AQ15436 765 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IQCA1Q86XH1 822 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.54■■□□□ 1.04
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 CTR9Q6PD62 1173 aa21.54■■□□□ 1.04
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