RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-215ENST00000589485 TEX11Q8IYF3 940 aa25.22■■□□□ 1.63
ILF3-215ENST00000589485 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ILF3-215ENST00000589485 LAMB1P07942 1786 aa25.21■■□□□ 1.63
ILF3-215ENST00000589485 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ILF3-215ENST00000589485 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
ILF3-215ENST00000589485 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 CYP7A1P22680 504 aa25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 GJA5P36382 358 aa25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 INHBEP58166 350 aa25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 MAP3K12Q12852 859 aa25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 DCTPP1Q9H773 170 aa25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.2■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 PLCG2P16885 1265 aa25.19■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 OTUD5Q96G74 571 aa25.19■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.19■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.18■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.18■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.18■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.18■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.18■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 INPP5BP32019 993 aa25.17■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 FOCADQ5VW36 1801 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 GOLIM4O00461 696 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 TBC1D8O95759 1140 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 ALDH1A1P00352 501 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 PPP4CP60510 307 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 ERO1BQ86YB8 467 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 IFFO2Q5TF58 517 aa25.15■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.15■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 IFNL1Q8IU54 200 aa25.15■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.15■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 ATP5JP18859 108 aa25.14■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 GTF2A2P52657 109 aa25.14■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.14■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.14■■□□□ 1.62
ILF3-215ENST00000589485 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.13■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.13■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 PPIL2Q13356 520 aa25.12■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.12■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 CERS3Q8IU89 383 aa25.12■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 GPATCH3Q96I76 525 aa25.12■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.11■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 PPATQ06203 517 aa25.11■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 CCL15Q16663 113 aa25.11■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.11■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 HAUS7Q99871 368 aa25.11■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 DOCK1Q14185 1865 aa25.11■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 FLT1P17948 1338 aa25.11■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 MYH1P12882 1939 aa25.1■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 MYH7P12883 1935 aa25.1■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 PDE6AP16499 860 aa25.1■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 29.3
ILF3-215ENST00000589485 PICK1Q9NRD5 415 aa25.1■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.1■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 IRF6O14896 467 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 SLURP2P0DP57 97 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 CETPP11597 493 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 USP5P45974 858 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 MAP3K10Q02779 954 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 SNAPC2Q13487 334 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.08■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 FAM196BA6NMK8 535 aa25.08■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 TBC1D12O60347 775 aa25.08■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 AAMPQ13685 434 aa25.08■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 PTPN18Q99952 460 aa25.08■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.08■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.611e-10■■□□□ 12.8
ILF3-215ENST00000589485 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.08■■□□□ 1.61
ILF3-215ENST00000589485 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.08■■□□□ 1.6
ILF3-215ENST00000589485 GPR25O00155 361 aa25.07■■□□□ 1.6
ILF3-215ENST00000589485 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.07■■□□□ 1.6
ILF3-215ENST00000589485 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
ILF3-215ENST00000589485 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
ILF3-215ENST00000589485 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.07■■□□□ 1.6
ILF3-215ENST00000589485 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ILF3-215ENST00000589485 CAPN15O75808 1086 aa25.06■■□□□ 1.6
ILF3-215ENST00000589485 DGKZQ13574 1117 aa25.06■■□□□ 1.6
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