RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SEC13P55735 322 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 RASSF7Q02833 373 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 DPYDQ12882 1025 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 DCTN1Q14203 1278 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SIX5Q8N196 739 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTLL6Q8N841 843 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SFI1A8K8P3 1242 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 NFKBIEO00221 500 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAN1A2O60476 641 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 AOC2O75106 756 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 LMNB1P20700 586 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDE6BP35913 854 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SMTNP53814 917 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM47Q96LD4 638 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SETDB2Q96T68 719 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF358Q9NW07 568 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 DKK1O94907 266 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAP2K2P36507 400 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 NFE2L2Q16236 605 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF787Q6DD87 383 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 STYK1Q6J9G0 422 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 LDHDQ86WU2 507 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CNBD1Q8NA66 436 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.343e-7■■■□□ 15.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 HINFPQ9BQA5 517 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 LAMB2P55268 1798 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 SCN4AP35499 1836 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 A6NJY4 79 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 M0R2N6 131 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 NEFMP07197 916 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 SRGNP10124 158 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 ST5P78524 1137 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TLR1Q15399 786 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 RNF217Q8TC41 542 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDK2AP1O14519 115 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 C21orf2O43822 256 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 MASTLQ96GX5 879 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 CACNA1AO00555 2505 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 SOBPA7XYQ1 873 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 NPHP1O15259 732 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 NPR1P16066 1061 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 POU4F2Q12837 409 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 RALBP1Q15311 655 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 HLFQ16534 295 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 GNASQ5JWF2 1037 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 SOGA3Q5TF21 947 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 SNED1Q8TER0 1413 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 ERBB4Q15303 1308 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 MTFR1Q15390 333 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 CNTROBQ8N137 903 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.61□□□□□ -1.35
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