RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576106.5

TRAP1-215, Transcript of TNF receptor associated protein 1, human

TSL 4

Gene TRAP1, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAP1-215	ENST00000576106	IFNL1	Q8IU54	200 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	GTF2A2	P52657	109 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	TEX11	Q8IYF3	940 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	27.84	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	OTUD5	Q96G74	571 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	TBC1D8	O95759	1140 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	PPP4C	P60510	307 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	MAP3K12	Q12852	859 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	27.83	■■■□□ 2.05
TRAP1-215	ENST00000576106	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	INPP5B	P32019	993 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	CYP7A1	P22680	504 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	27.8	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	MAP3K10	Q02779	954 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	PPAT	Q06203	517 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	PPIL2	Q13356	520 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	CERS3	Q8IU89	383 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	DCTPP1	Q9H773	170 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	GPR25	O00155	361 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	CCL15	Q16663	113 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	TBC1D12	O60347	775 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	CETP	P11597	493 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	ATP5J	P18859	108 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	SNAPC2	Q13487	334 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	PTPN18	Q99952	460 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TRAP1-215	ENST00000576106	IRF6	O14896	467 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	DGKZ	Q13574	1117 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	GOLIM4	O00461	696 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	CAPN15	O75808	1086 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	CRBN	Q96SW2	442 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	PICK1	Q9NRD5	415 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	OTOF	Q9HC10	1997 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03	3e-6	■□□□□ 9.3
TRAP1-215	ENST00000576106	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	FKTN	O75072	461 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	ABHD8	Q96I13	439 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	FLT1	P17948	1338 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	HAUS7	Q99871	368 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	PDE6A	P16499	860 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	CRHR2	Q13324	411 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	GPATCH3	Q96I76	525 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAP1-215	ENST00000576106	USP5	P45974	858 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	CXCL11	O14625	94 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	SLURP2	P0DP57	97 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	PTPRA	P18433	802 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	AAMP	Q13685	434 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	27.69	■■■□□ 2.02	3e-7	■□□□□ 10.9
TRAP1-215	ENST00000576106	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TRAP1-215	ENST00000576106	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02

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