RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 ABCF2Q9UG63 623 aa26.9■■□□□ 1.9
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EHD4-202ENST00000569223 SLC39A14Q15043 492 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD4-202ENST00000569223 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.9■■□□□ 1.9
EHD4-202ENST00000569223 RAI14Q9P0K7 980 aa26.9■■□□□ 1.9
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EHD4-202ENST00000569223 VPS72Q15906 364 aa26.88■■□□□ 1.89
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EHD4-202ENST00000569223 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.87■■□□□ 1.89
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EHD4-202ENST00000569223 SMIM22K7EJ46 135 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
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