RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.06□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 GDNFP39905 211 aa6.05□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 KCNN1Q92952 543 aa6.05□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 PIDD1Q9HB75 910 aa6.05□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.04□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.04□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 STK32AQ8WU08 396 aa6.04□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.04□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.04□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.04□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 SRFP11831 508 aa6.03□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 PDE3AQ14432 1141 aa6.03□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.03□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.03□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 EDEM1Q92611 657 aa6.03□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 SUV39H1O43463 412 aa6.02□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.02□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.02□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 A0A096LPE4 126 aa6.01□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1W2PPZ6 126 aa6.01□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 TRIM13O60858 407 aa6.01□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 CELA3BP08861 270 aa6.01□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 DISC1Q9NRI5 854 aa6.01□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 ATG7O95352 703 aa6□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 TTLL4Q14679 1199 aa6□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 C8orf34Q49A92 452 aa6□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM164Q5U3C3 297 aa6□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 IGHA2P01877 340 aa5.99□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 PDGFAP04085 211 aa5.99□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 LIG1P18858 919 aa5.99□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 CLCN7P51798 805 aa5.99□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 ID3Q02535 119 aa5.99□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.99□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.99□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.99□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 PHACTR2O75167 634 aa5.98□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 B3GALT4O96024 378 aa5.98□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 GRIA4P48058 902 aa5.98□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 TNFRSF21O75509 655 aa5.97□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 PCSK2P16519 638 aa5.97□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 CCNJLQ8IV13 435 aa5.97□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 ABHD4Q8TB40 342 aa5.97□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 SLAIN2Q9P270 581 aa5.97□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.97□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.97□□□□□ -1.45
FAM227B-211ENST00000560557 ARID3CA6NKF2 412 aa5.96□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 NEFMP07197 916 aa5.96□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.96□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 PBXIP1Q96AQ6 731 aa5.96□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.95□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.95□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF862O60290 1169 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 SLFN14P0C7P3 912 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 DLG4P78352 724 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 TTC16Q8NEE8 873 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 ISL2Q96A47 359 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 TCF12Q99081 682 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 OVOL3O00110 214 aa5.93□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 AP3B2Q13367 1082 aa5.93□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.93□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC120Q96HB5 630 aa5.93□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.93□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 INSRRP14616 1297 aa5.92□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 ATP2B4P23634 1241 aa5.92□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 EFEMP1Q12805 493 aa5.92□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 CRELD1Q96HD1 420 aa5.92□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF576Q9H609 170 aa5.92□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 SEPT3Q9UH03 358 aa5.92□□□□□ -1.46
FAM227B-211ENST00000560557 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms