RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 PDE3AQ14432 1141 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 KCNMB1Q16558 191 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 KRT82Q9NSB4 513 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 SLFN14P0C7P3 912 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 SSFA2P28290 1259 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 MLANAQ16655 118 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 PIDD1Q9HB75 910 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 LIG1P18858 919 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 TTLL4Q14679 1199 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 ASB11Q8WXH4 323 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 ABCB6Q9NP58 842 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 B8ZZF3 427 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 NEFMP07197 916 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 GLI1P08151 1106 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 AFMP43652 599 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 AAMPQ13685 434 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 FYB2Q5VWT5 728 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 PDZD3Q86UT5 571 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-202ENST00000558300 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 ZP2Q05996 745 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 FAAP100Q0VG06 881 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 ARID3AQ99856 593 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 C1QTNF9P0C862 333 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 ISL2Q96A47 359 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 EHD4Q9H223 541 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 ARID3CA6NKF2 412 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 NEFLP07196 543 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 ERVK-24P63145 666 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 RNF214Q8ND24 703 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.5□□□□□ -1.37
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TMOD3-202ENST00000558300 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 ITIH2P19823 946 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 CLCN7P51798 805 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 IKZF1Q13422 519 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 ECM1Q16610 540 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 CD320Q9NPF0 282 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 MED14OSP0DP75 135 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 KIRREL1Q96J84 757 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 NPHS2Q9NP85 383 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 GDNFP39905 211 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-202ENST00000558300 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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TMOD3-202ENST00000558300 NTF4P34130 210 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 FAM129BQ96TA1 746 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 MTMR7Q9Y216 660 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 NFIBO00712 420 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 RING1Q06587 406 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.45□□□□□ -1.38
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TMOD3-202ENST00000558300 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 EOMESO95936 686 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 IGHA2P01877 340 aa6.44□□□□□ -1.38
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TMOD3-202ENST00000558300 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 INHBBP09529 407 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-202ENST00000558300 GLDCP23378 1020 aa6.43□□□□□ -1.38
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