RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 SHC4Q6S5L8 630 aa24.58■■□□□ 1.53
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TMEM260-216ENST00000557657 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TMEM260-216ENST00000557657 AK7Q96M32 723 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM260-216ENST00000557657 CAVIN2O95810 425 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM260-216ENST00000557657 EVX2Q03828 476 aa24.57■■□□□ 1.52
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TMEM260-216ENST00000557657 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
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TMEM260-216ENST00000557657 FAM182BQ5T319 152 aa24.49■■□□□ 1.51
TMEM260-216ENST00000557657 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.49■■□□□ 1.51
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TMEM260-216ENST00000557657 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TMEM260-216ENST00000557657 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TMEM260-216ENST00000557657 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.49■■□□□ 1.51
TMEM260-216ENST00000557657 FAM205CA6NFA0 338 aa24.48■■□□□ 1.51
TMEM260-216ENST00000557657 SKILP12757 684 aa24.48■■□□□ 1.51
TMEM260-216ENST00000557657 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TMEM260-216ENST00000557657 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.48■■□□□ 1.51
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