RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCAPHQ15003 741 aa23.12■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.12■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.12■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 PNOCQ13519 176 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPECC1Q5M775 1068 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL4A1P02462 1669 aa23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.293e-10■■■■■ 30.7
AFG3L1P-217ENST00000557444 LIFRP42702 1097 aa23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM29Q14134 588 aa23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 HPSEQ9Y251 543 aa23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 DOCK2Q92608 1830 aa23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAMTA2O94983 1202 aa23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 ITPK1Q13572 414 aa23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 BTBD18B2RXH4 712 aa23.09■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP1A3P13637 1013 aa23.09■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.09■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP6R2O75170 966 aa23.09■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMC6Q7Z403 805 aa23.09■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.09■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHRNDQ07001 517 aa23.08■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.08■■□□□ 1.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMTNL1A8MU46 457 aa23.08■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 NEMFO60524 1076 aa23.08■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 LONRF3Q496Y0 759 aa23.08■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.08■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP135Q66GS9 1140 aa23.08■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 AK7Q96M32 723 aa23.08■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.08■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRIN1Q05586 938 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXN1O15353 648 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 NTSR2O95665 410 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 SIK1P57059 783 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 RESP18Q5W5W9 173 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT23Q9C075 422 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCF2Q9UG63 623 aa23.07■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAMTS2O95450 1211 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFNAR1P17181 557 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 WTAPQ15007 396 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPN21Q16825 1174 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARMCX5Q6P1M9 558 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 JMYQ8N9B5 988 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.05■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 NR5A1Q13285 461 aa23.05■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 RTN1Q16799 776 aa23.05■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD7Q92527 254 aa23.05■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 TIGD1Q96MW7 591 aa23.05■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.05■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 GYG1P46976 350 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDB1Q16531 1140 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 STK36Q9NRP7 1315 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 MMP1P03956 469 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP7A1P22680 504 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPN14Q15678 1187 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 FANCCQ00597 558 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 RGS22Q8NE09 1264 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 DPF2Q92785 391 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAF1P21675 1872 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PHLPP1O60346 1717 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.03■■□□□ 1.28
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