RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM170B	A6NMN3	283 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP11A1	P05108	521 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	MAOB	P27338	520 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF394	Q53GI3	561 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	USP31	Q70CQ4	1352 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PP55	124 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	CTSB	P07858	339 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIA4	P48058	902 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP7	Q14244	749 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	POU4F3	Q15319	338 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	TCF12	Q99081	682 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	NPHS2	Q9NP85	383 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	GIPC1	O14908	333 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	NFIC	P08651	508 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGB5	P18084	799 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB6A	P20340	208 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP27A1	Q02318	531 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	FZD5	Q13467	585 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	DYM	Q7RTS9	669 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	USP48	Q86UV5	1035 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	BCO2	Q9BYV7	579 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	USP17L7	P0C7H9	530 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	OGFOD2	Q6N063	350 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	FLCN	Q8NFG4	579 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ASIC4	Q96FT7	647 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	GML	Q99445	158 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	CORO1B	Q9BR76	489 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD18	Q9NS91	495 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	GGT7	Q9UJ14	662 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ECEL1	O95672	775 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	B3GALT4	O96024	378 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ITPKA	P23677	461 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ASPA	P45381	313 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	GRM2	Q14416	872 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	DPH6	Q7L8W6	267 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF576	Q9H609	170 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	COPRS	Q9NQ92	184 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	AOC2	O75106	756 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP2B1	P20020	1258 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	6.22	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	ARID5A	Q03989	594 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR18	Q9BV38	432 aa		6.22	□□□□□ -1.41

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