RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.33■□□□□ 0.84
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PKP3-209ENST00000533069 CCL15Q16663 113 aa20.28■□□□□ 0.84
PKP3-209ENST00000533069 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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PKP3-209ENST00000533069 PTPN18Q99952 460 aa20.27■□□□□ 0.84
PKP3-209ENST00000533069 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.27■□□□□ 0.84
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PKP3-209ENST00000533069 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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PKP3-209ENST00000533069 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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PKP3-209ENST00000533069 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.2■□□□□ 0.82
PKP3-209ENST00000533069 BTBD19C9JJ37 291 aa20.19■□□□□ 0.82
PKP3-209ENST00000533069 PDE6AP16499 860 aa20.19■□□□□ 0.82
PKP3-209ENST00000533069 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.19■□□□□ 0.82
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.19■□□□□ 0.82
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PKP3-209ENST00000533069 HAUS7Q99871 368 aa20.19■□□□□ 0.82
PKP3-209ENST00000533069 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.19■□□□□ 0.82
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