RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 STOML1Q9UBI4 398 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 F6X3S4 739 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 ADMP35318 185 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 ID3Q02535 119 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 MAP3K11Q16584 847 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 DYMQ7RTS9 669 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 BACH2Q9BYV9 841 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 CBX8Q9HC52 389 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 COPRSQ9NQ92 184 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 RAD18Q9NS91 495 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 NFICP08651 508 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 RNF43Q68DV7 783 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 PRR19A6NJB7 356 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 GFRA2O00451 464 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 GARTP22102 1010 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 ASPAP45381 313 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 ERVK-24P63145 666 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 SEPT6Q14141 434 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 RHOVQ96L33 236 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 RECKO95980 971 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 SLFN14P0C7P3 912 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 NFIAQ12857 509 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 TTLL4Q14679 1199 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC14Q15048 493 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 C12orf40Q86WS4 652 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF428Q96B54 188 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 MRS2Q9HD23 443 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 CSADQ9Y600 493 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 FAM221AA4D161 298 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 IGLV1-40P01703 118 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 RAB6AP20340 208 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 VAMP1P23763 118 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 USP11P51784 963 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 PPM1JQ5JR12 505 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 ISL2Q96A47 359 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 SAMM50Q9Y512 469 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 MED26O95402 600 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 F13BP05160 661 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 RNF214Q8ND24 703 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM74Q96NL1 305 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 LGR6Q9HBX8 967 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 PF4P02776 101 aa6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 FANCCQ00597 558 aa6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 SLC51AQ86UW1 340 aa6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 FAM170BA6NMN3 283 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 CILPO75339 1184 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 RXRBP28702 533 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 LMNB2Q03252 620 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 NFKBIBQ15653 356 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 ZAR1Q86SH2 424 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 FBRSQ9HAH7 460 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 U3KQE9 123 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 GREM1O60565 184 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 F13A1P00488 732 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 TGFB1P01137 390 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-209ENST00000522928 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms