RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCL15Q16663 113 aa20.64■□□□□ 0.89
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.64■□□□□ 0.89
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 IRF6O14896 467 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGS19P49795 217 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRHR2Q13324 411 aa20.63■□□□□ 0.89
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.6■□□□□ 0.89
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERO1AQ96HE7 468 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLCG2P16885 1265 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SP3Q02447 781 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BTBD19C9JJ37 291 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXCL11O14625 94 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF6Q15052 776 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PICK1Q9NRD5 415 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM17Q9Y577 477 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRAP18433 802 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DOCK2Q92608 1830 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CERS3Q8IU89 383 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EFCC1Q9HA90 598 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MOGSQ13724 837 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDHXO00330 501 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLURP2P0DP57 97 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP7A1P22680 504 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP3K12Q12852 859 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APBB1O00213 710 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C17orf99Q6UX52 265 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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