RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 PTPRAP18433 802 aa19.81■□□□□ 0.76
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SH3BP2-215ENST00000510074 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 ZFPM1Q8IX07 1006 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 COA7Q96BR5 231 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 STAP2Q9UGK3 403 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 PHF20L1A8MW92 1017 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 IRF5Q13568 498 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 USP44Q9H0E7 712 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa19.8■□□□□ 0.76
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SH3BP2-215ENST00000510074 RGS3P49796 1198 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 CEP126Q9P2H0 1117 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 NECAB2Q7Z6G3 386 aa19.78■□□□□ 0.76
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP2-215ENST00000510074 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa19.77■□□□□ 0.76
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SH3BP2-215ENST00000510074 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 SLF2Q8IX21 1173 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 LRCH3Q96II8 777 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 SIL1Q9H173 461 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP2-215ENST00000510074 ANP32CO43423 234 aa19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP2-215ENST00000510074 ATG9AQ7Z3C6 839 aa19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP2-215ENST00000510074 MAP3K10Q02779 954 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 PICALMQ13492 652 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 ABCF2Q9UG63 623 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 FBXO3Q9UK99 471 aa19.74■□□□□ 0.75
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SH3BP2-215ENST00000510074 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP19.73■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 22.7
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SH3BP2-215ENST00000510074 PHKA1P46020 1223 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM110CQ1W6H9 321 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 C7orf61Q8IZ16 206 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 ATRNL1Q5VV63 1379 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 BMP8BP34820 402 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
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SH3BP2-215ENST00000510074 MGAMO43451 1857 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-215ENST00000510074 HMGCRP04035 888 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 SLURP2P0DP57 97 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 IL15P40933 162 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 BTDP43251 543 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 SPP2Q13103 211 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 TREML2Q5T2D2 321 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC102BQ68D86 513 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 DEFB123Q8N688 67 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 GDF15Q99988 308 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 36.9
SH3BP2-215ENST00000510074 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
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SH3BP2-215ENST00000510074 A0A0C4DFX4 3053 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 GPR153Q6NV75 609 aa19.69■□□□□ 0.74
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SH3BP2-215ENST00000510074 HDAC5Q9UQL6 1122 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 RPTORQ8N122 1335 aa19.69■□□□□ 0.74
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF280CQ8ND82 737 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 ADORA1P30542 326 aa19.67■□□□□ 0.74
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SH3BP2-215ENST00000510074 TIMM10P62072 90 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 C11orf49Q9H6J7 331 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 MYH13Q9UKX3 1938 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 SYN1P17600 705 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 HMGCS2P54868 508 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 COL6A3P12111 3177 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM196BA6NMK8 535 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP2-215ENST00000510074 LDHCP07864 332 aa19.65■□□□□ 0.74
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