RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa28.63■■■□□ 2.17
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM43AQ8N2R8 423 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERO1AQ96HE7 468 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM17Q9Y577 477 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.6■■■□□ 2.17
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SOX10P56693 466 aa28.59■■■□□ 2.17
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD99L2Q8TCZ2 262 aa28.59■■■□□ 2.17
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEX11Q8IYF3 940 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EFCC1Q9HA90 598 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BAG3O95817 575 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCYL3Q8IZE3 742 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNH4Q9UQ05 1017 aa28.54■■■□□ 2.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K10Q02779 954 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AACSQ86V21 672 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF6Q15052 776 aa28.52■■■□□ 2.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 APBB1O00213 710 aa28.5■■■□□ 2.15
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPA4Q9UI42 421 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GADL1Q6ZQY3 521 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PI4KBQ9UBF8 816 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDE3AQ14432 1141 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.43■■■□□ 2.14
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