RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHSY3Q70JA7 882 aa6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 NLRP8Q86W28 1048 aa6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIGBQ92521 554 aa6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZIC5Q96T25 663 aa6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNNQ9UQP3 1299 aa6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF16BQ96L93 1317 aa6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNS2Q63HR2 1409 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 A6NJY4 79 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 GNB5O14775 395 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 STARD3NLO95772 234 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 TXLNAP40222 546 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 BECN1Q14457 450 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCM6Q14566 821 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM11Q96F44 468 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 HYPKQ9NX55 129 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 CACNA1FO60840 1977 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDK2AP1O14519 115 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 NFKBIBQ15653 356 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARXQ96QS3 562 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATG3Q9NT62 314 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPRCP08575 1304 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITGB4P16144 1822 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 EFSO43281 561 aa6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM27P14373 513 aa6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYL6BP14649 208 aa6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADH6P28332 368 aa6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM182BQ5T319 152 aa6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 MDFIQ99750 246 aa6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP16Q9Y5T5 823 aa6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC37A3O60309 1634 aa6.9□□□□□ -1.3
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNQ2O43526 872 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM157BP0CG42 384 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 EPHA4P54764 986 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 FLIIQ13045 1269 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBCELQ5QJ74 424 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-215ENST00000498517 BCL9O00512 1426 aa6.9□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 GLI3P10071 1580 aa6.9□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.89□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.89□□□□□ -1.31
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SIK1P57059 783 aa6.89□□□□□ -1.31
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SEMA3FQ13275 785 aa6.89□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 Q8N3U1 123 aa6.89□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.89□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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ARHGEF3-215ENST00000498517 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.89□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRC1P22897 1456 aa6.89□□□□□ -1.31
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ARHGEF3-215ENST00000498517 A1BGP04217 495 aa6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 WASHC4Q2M389 1173 aa6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 KSR2Q6VAB6 950 aa6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 COPS6Q7L5N1 327 aa6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 G2E3Q7L622 706 aa6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMC5Q8IY18 1101 aa6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 POM121Q96HA1 1249 aa6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.88□□□□□ -1.31
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