RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484179.5

USP34-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 927 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-215	ENST00000484179	USP5	P45974	858 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	NCOA1	Q15788	1441 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		7.31	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	TCF3	P15923	654 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	RNF208	Q9H0X6	261 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		7.3	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	ATP7A	Q04656	1500 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	PRR19	A6NJB7	356 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	PAX4	O43316	350 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	SPINK2	P20155	84 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	IRAK1	P51617	712 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	TTC16	Q8NEE8	873 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	A2M	P01023	1474 aa		7.29	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	BMP3	P12645	472 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	ACPP	P15309	386 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	ARL4D	P49703	201 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	BEND4	Q6ZU67	534 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	BCL11A	Q9H165	835 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	SOX13	Q9UN79	622 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		7.28	□□□□□ -1.24
USP34-215	ENST00000484179	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	MEGF11	A6BM72	1044 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179		A6NHS1	94 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	PREP	P48147	710 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	NLRP12	P59046	1061 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	ATP2B2	Q01814	1243 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	DTX1	Q86Y01	620 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	PARP2	Q9UGN5	583 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	PLXNC1	O60486	1568 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		7.27	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25	9e-6	■■■□□ 18.6
USP34-215	ENST00000484179	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	FGD1	P98174	961 aa		7.26	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	ORC1	Q13415	861 aa		7.26	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	FDX2	Q6P4F2	183 aa		7.26	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	GGT6	Q6P531	493 aa		7.26	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7.26	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7.26	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		7.26	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	HHIP	Q96QV1	700 aa		7.26	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	PTPRK	Q15262	1439 aa		7.26	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	TOM1	O60784	492 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	IGSF3	O75054	1194 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	TRPA1	O75762	1119 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	TXK	P42681	527 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	CPS1	P31327	1500 aa		7.25	□□□□□ -1.25
USP34-215	ENST00000484179	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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