RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.37□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 MED23Q9ULK4 1368 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 M0R2C6 588 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 HIP1O00291 1037 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 TM4SF1P30408 202 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 MCAMP43121 646 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 NEK4P51957 841 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 DDR1Q08345 913 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC102BQ68D86 513 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 NYXQ9GZU5 481 aa7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 A0A0G2JLW4 131 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SLC5A1P13866 664 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 MCCP23508 829 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 KLRK1P26718 216 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 VPS53Q5VIR6 699 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 LPIN2Q92539 896 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 MAP4K1Q92918 833 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 NLRP3Q96P20 1036 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 LAMA4Q16363 1823 aa7.35□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 DOCK2Q92608 1830 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 MAST3O60307 1309 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SLC27A2O14975 620 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 NPHP1O15259 732 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 DTNBO60941 627 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SERPINB2P05120 415 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 SSFA2P28290 1259 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 GYG1P46976 350 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 KCNJ4P48050 445 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 ANAPC15P60006 121 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RASGRF1Q13972 1273 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 NECTIN1Q15223 517 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 CNBD1Q8NA66 436 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 OSBP2Q969R2 916 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.34□□□□□ -1.23
SKAP2-204ENST00000481204 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 PLSCR1O15162 318 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 DDIT3P35638 169 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 WASHC4Q2M389 1173 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 MSL1Q68DK7 614 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 FBXO41Q8TF61 875 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 TSC1Q92574 1164 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 KCNB2Q92953 911 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 IL17RAQ96F46 866 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 POM121Q96HA1 1249 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.33□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 FOXP2O15409 715 aa7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 CASTP20810 708 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 RPIAP49247 311 aa7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 NFKBIBQ15653 356 aa7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 PTPRNQ16849 979 aa7.32□□□□□ -1.24
SKAP2-204ENST00000481204 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms