RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.41■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.41■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 LPIN2Q92539 896 aa23.41■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 EYA2O00167 538 aa23.4■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 SLC5A1P13866 664 aa23.4■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 IRF5Q13568 498 aa23.4■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.4■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 MRS2Q9HD23 443 aa23.4■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.4■■□□□ 1.34
LINC00888-201ENST00000468380 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 MAP3K10Q02779 954 aa23.39■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.39■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.39■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 RGS3P49796 1198 aa23.38■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 PICK1Q9NRD5 415 aa23.38■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.38■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 IDI2Q9BXS1 227 aa23.37■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 ALPK3Q96L96 1907 aa23.35■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 ENTPD3O75355 529 aa23.35■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.35■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 GDF15Q99988 308 aa23.35■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.35■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.34■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.34■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 TRIM75PA6NK02 468 aa23.34■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 CAPN2P17655 700 aa23.34■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.33■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 PHKA1P46020 1223 aa23.33■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 TREML2Q5T2D2 321 aa23.33■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
LINC00888-201ENST00000468380 PTPRFP10586 1907 aa23.32■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.32■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 BMP8BP34820 402 aa23.32■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.32■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 COA7Q96BR5 231 aa23.32■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.32■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 GAKO14976 1311 aa23.32■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.31■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 ATP2B3Q16720 1220 aa23.31■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 SIL1Q9H173 461 aa23.31■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.31■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 TRIM32Q13049 653 aa23.3■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.3■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.3■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 GJD2Q9UKL4 321 aa23.3■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 PTPRCP08575 1304 aa23.3■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 DOCK2Q92608 1830 aa23.29■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 ADORA1P30542 326 aa23.29■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.29■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 Q7L0L9 218 aa23.29■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.29■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 PICALMQ13492 652 aa23.28■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 DEFB123Q8N688 67 aa23.28■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.28■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 SEMA3EO15041 775 aa23.27■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 CIAO1O76071 339 aa23.27■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 SYN1P17600 705 aa23.27■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 GPR153Q6NV75 609 aa23.27■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.27■■□□□ 1.32
LINC00888-201ENST00000468380 FAM196BA6NMK8 535 aa23.26■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 HMGCRP04035 888 aa23.26■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 SPP2Q13103 211 aa23.26■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC102BQ68D86 513 aa23.26■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 FBXO3Q9UK99 471 aa23.26■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF521Q96K83 1311 aa23.26■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 DOCK1Q14185 1865 aa23.26■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 ZBTB22O15209 634 aa23.25■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 TBC1D12O60347 775 aa23.25■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 BTDP43251 543 aa23.25■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 RHBDL3P58872 404 aa23.25■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 NBPF3Q9H094 633 aa23.25■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 RPTORQ8N122 1335 aa23.25■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 RASGRF1Q13972 1273 aa23.24■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.24■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF384Q8TF68 577 aa23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms