RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	IDI2	Q9BXS1	227 aa		21.53	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	ENTPD3	O75355	529 aa		21.52	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		21.52	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	21.52	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		21.52	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	ERC2	O15083	957 aa		21.51	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	MX1	P20591	662 aa		21.51	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	21.51	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	DCAF15	Q66K64	600 aa		21.51	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		21.51	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	LNPK	Q9C0E8	428 aa		21.51	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	21.51	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		21.51	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	SLC10A3	P09131	477 aa		21.5	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	PDE6A	P16499	860 aa		21.5	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	PPP4C	P60510	307 aa		21.5	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	MAP3K11	Q16584	847 aa		21.5	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		21.5	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		21.5	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	SMC5	Q8IY18	1101 aa		21.5	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	CSRNP1	Q96S65	589 aa		21.5	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	OTOF	Q9HC10	1997 aa		21.49	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		21.49	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		21.49	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		21.49	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		21.49	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		21.48	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	21.48	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	WRNIP1	Q96S55	665 aa		21.48	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		21.48	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	CSAD	Q9Y600	493 aa		21.48	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		21.48	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		21.48	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	21.47	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	USP5	P45974	858 aa		21.47	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	MAP3K9	P80192	1104 aa		21.47	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		21.47	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	CERS3	Q8IU89	383 aa		21.47	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		21.47	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	TSKS	Q9UJT2	592 aa		21.47	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	MYH1	P12882	1939 aa		21.47	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	ADD2	P35612	726 aa		21.46	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		21.46	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		21.46	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		21.46	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	ELP3	Q9H9T3	547 aa		21.46	■■□□□ 1.03
USP19-210	ENST00000465902	UNCX	A6NJT0	531 aa		21.45	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	NUCB1	Q02818	461 aa		21.45	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		21.45	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	21.45	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		21.44	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	CAPN15	O75808	1086 aa		21.44	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	VGLL4	Q14135	290 aa		21.44	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		21.44	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	FLT1	P17948	1338 aa		21.44	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	PDE1A	P54750	535 aa		21.43	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	SPRYD7	Q5W111	196 aa		21.43	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		21.43	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		21.43	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	CHGB	P05060	677 aa		21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	INPP5B	P32019	993 aa		21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	UBE3C	Q15386	1083 aa		21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	OPTN	Q96CV9	577 aa		21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	WNK4	Q96J92	1243 aa		21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	FSD1	Q9BTV5	496 aa		21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	ARMT1	Q9H993	441 aa		21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	STAP2	Q9UGK3	403 aa		21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	PALD1	Q9ULE6	856 aa		21.42	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		21.41	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	MBD4	O95243	580 aa		21.41	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	SLURP2	P0DP57	97 aa		21.41	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		21.41	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	FAM196B	A6NMK8	535 aa		21.4	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	NEFL	P07196	543 aa		21.4	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	LCORL	Q8N3X6	602 aa		21.4	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		21.4	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	OTUD5	Q96G74	571 aa		21.4	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	RNF186	Q9NXI6	227 aa		21.4	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		21.4	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		21.4	■■□□□ 1.02
USP19-210	ENST00000465902	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.02

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