RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 IFNKQ9P0W0 207 aa21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 STK36Q9NRP7 1315 aa21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 ERICH2A1L162 156 aa21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 PTPAQ15257 358 aa21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 SHC4Q6S5L8 630 aa21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF11Q86T75 865 aa21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 ISM2Q6H9L7 571 aa21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 MAP3K14Q99558 947 aa21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 HPSEQ9Y251 543 aa21.15■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 BCAMP50895 628 aa21.14■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 PARP10Q53GL7 1025 aa21.14■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.14■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.14■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.14■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 USP27XA6NNY8 438 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 PRKAB2O43741 272 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 IFNAR1P17181 557 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 WTAPQ15007 396 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 TMC6Q7Z403 805 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 LCORLQ8N3X6 602 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 IKBKBO14920 756 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 NRDCO43847 1150 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 CUTAO60888 179 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 ATP6V1AP38606 617 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 RESP18Q5W5W9 173 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 CLIC6Q96NY7 704 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.13■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 RTN1Q16799 776 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 SLIT2O94813 1529 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 NCAPHQ15003 741 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD7Q92527 254 aa21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 TMTC2Q8N394 836 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 CNNM3Q8NE01 707 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 PNOCQ13519 176 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.11■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 MMP1P03956 469 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 SYCP1Q15431 976 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 BTBD18B2RXH4 712 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 FANCCQ00597 558 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 OLFM4Q6UX06 510 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 DOCK2Q92608 1830 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 NID2Q14112 1375 aa21.09■□□□□ 0.97
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SYNE4-204ENST00000465425 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 DEXIO95424 95 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 GUCY1A2P33402 732 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 MTA3Q9BTC8 594 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 KCND1Q9NSA2 647 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.08■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 SERPINC1P01008 464 aa21.08■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 DDB1Q16531 1140 aa21.08■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 LONRF3Q496Y0 759 aa21.08■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.08■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.08■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.08■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 ABCF2Q9UG63 623 aa21.08■□□□□ 0.97
SYNE4-204ENST00000465425 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.08■□□□□ 0.97
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