RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.36	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.36	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	RGS3	P49796	1198 aa		13.36	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.36	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.36	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.36	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	MYH1	P12882	1939 aa		13.35	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	ERC2	O15083	957 aa		13.35	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.35	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.35	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.35	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.35	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP7A1	P22680	504 aa		13.34	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	FOXN1	O15353	648 aa		13.34	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.34	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	APBB1	O00213	710 aa		13.34	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	CACNB3	P54284	484 aa		13.34	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.34	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.34	□□□□□ -0.27
UBXN7-205	ENST00000429160	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	GTF2A2	P52657	109 aa		13.33	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PPIL2	Q13356	520 aa		13.33	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.33	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PPAT	Q06203	517 aa		13.33	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	NFIA	Q12857	509 aa		13.33	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	GRM1	Q13255	1194 aa		13.33	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.33	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.33	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	VGLL4	Q14135	290 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PDE6A	P16499	860 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	TCP10	Q12799	353 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PRKG1	Q13976	671 aa		13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	GOLIM4	O00461	696 aa		13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	ADD2	P35612	726 aa		13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	EHD4	Q9H223	541 aa		13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.31	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	FLT1	P17948	1338 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	CETP	P11597	493 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PICALM	Q13492	652 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.3	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	CXCL11	O14625	94 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	USP5	P45974	858 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	MX1	P20591	662 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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