RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.41□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNRKQ9NRH2 765 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ECHDC1Q9NTX5 307 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM198AQ9UFP1 575 aa10.41□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AOC2O75106 756 aa10.4□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP2O75604 605 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGS3P49796 1198 aa10.4□□□□□ -0.74
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CACNB3P54284 484 aa10.4□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NFIAQ12857 509 aa10.4□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPRYD7Q5W111 196 aa10.4□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa10.4□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CSRNP1Q96S65 589 aa10.4□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.4□□□□□ -0.74
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TM4SF4P48230 202 aa10.39□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP3K10Q02779 954 aa10.39□□□□□ -0.75
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa10.39□□□□□ -0.75
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WRNIP1Q96S55 665 aa10.39□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.39□□□□□ -0.75
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF112Q9UJU3 913 aa10.39□□□□□ -0.75
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCP10Q12799 353 aa10.38□□□□□ -0.75
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDE6AP16499 860 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GTF2A2P52657 109 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPATQ06203 517 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPIL2Q13356 520 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PICALMQ13492 652 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE3CQ15386 1083 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMC5Q8IY18 1101 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PI4KBQ9UBF8 816 aa10.37□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FLT1P17948 1338 aa10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MX1P20591 662 aa10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OPTNQ96CV9 577 aa10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLMNQ96JQ2 1002 aa10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EHD4Q9H223 541 aa10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANTXR1Q9H6X2 564 aa10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa10.36□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATAD5Q96QE3 1844 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CXCL11O14625 94 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CETPP11597 493 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADD2P35612 726 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNAPC2Q13487 334 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC6Q86TZ1 520 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCYL3Q8IZE3 742 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.35□□□□□ -0.75
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