RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 NLRP1Q9C000 1473 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 KDM1AO60341 852 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEK2P51955 445 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 HAUS8Q9BT25 410 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADGRB3O60242 1522 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 AMPHP49418 695 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 AMPD3Q01432 767 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRT10P13645 584 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CLUL1Q15846 466 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEK1Q96PY6 1258 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 RMND1Q9NWS8 449 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC102BQ68D86 513 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 WDR81Q562E7 1941 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 POTEB3A0JP26 581 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 MTMR3Q13615 1198 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 POTEBQ6S5H4 581 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 TEX11Q8IYF3 940 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 NME8Q8N427 588 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 RAB34Q9BZG1 259 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 I3L4J1 428 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHUKO15111 745 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 USP48Q86UV5 1035 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 SNX21Q969T3 373 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 EXOC4Q96A65 974 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 DIABLOQ9NR28 239 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 FCHSD2O94868 740 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRT7P08729 469 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC25Q86WR0 208 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CNGA4Q8IV77 575 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CLTCL1P53675 1640 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATP8B1O43520 1251 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 PCM1Q15154 2024 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 N4BP3O15049 544 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 MAP3K7O43318 606 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPFIA4O75335 1185 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 SYNCQ9H7C4 482 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYO1BO43795 1136 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 C8orf74Q6P047 294 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 OPTNQ96CV9 577 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 BAG2O95816 211 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCT5P48643 541 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 SIL1Q9H173 461 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CD163L1Q9NR16 1453 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSPA1LP34931 641 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF445P59923 1031 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.8 ms