RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
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PTPRC-202ENST00000367364 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 NPHS2Q9NP85 383 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.07□□□□□ -0.96
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRC-202ENST00000367364 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
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PTPRC-202ENST00000367364 IKZF1Q13422 519 aa9.03□□□□□ -0.96
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PTPRC-202ENST00000367364 ASB11Q8WXH4 323 aa9.02□□□□□ -0.97
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PTPRC-202ENST00000367364 ECM1Q16610 540 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-202ENST00000367364 NKPD1Q17RQ9 610 aa9□□□□□ -0.97
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PTPRC-202ENST00000367364 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
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PTPRC-202ENST00000367364 CLCN7P51798 805 aa8.92□□□□□ -0.98
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PTPRC-202ENST00000367364 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.92□□□□□ -0.98
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PTPRC-202ENST00000367364 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 NFIBO00712 420 aa8.9□□□□□ -0.98
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PTPRC-202ENST00000367364 DIRC2Q96SL1 478 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 KCNK12Q9HB15 430 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-202ENST00000367364 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.9□□□□□ -0.98
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