RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 PRDX5P30044 214 aa21.68■■□□□ 1.06
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SNX11-201ENST00000359238 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.68■■□□□ 1.06
SNX11-201ENST00000359238 NEDD4P46934 1319 aa21.68■■□□□ 1.06
SNX11-201ENST00000359238 UTRNP46939 3433 aa21.68■■□□□ 1.06
SNX11-201ENST00000359238 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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SNX11-201ENST00000359238 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.59■■□□□ 1.05
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SNX11-201ENST00000359238 KIF18AQ8NI77 898 aa21.58■■□□□ 1.05
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SNX11-201ENST00000359238 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.58■■□□□ 1.05
SNX11-201ENST00000359238 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.58■■□□□ 1.05
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SNX11-201ENST00000359238 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.58■■□□□ 1.04
SNX11-201ENST00000359238 CHRNA5P30532 468 aa21.58■■□□□ 1.04
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SNX11-201ENST00000359238 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.58■■□□□ 1.04
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SNX11-201ENST00000359238 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SNX11-201ENST00000359238 FBXL16Q8N461 479 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX11-201ENST00000359238 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SNX11-201ENST00000359238 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.57■■□□□ 1.04
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