RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFA8P51970 172 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-201ENST00000357436 STK38Q15208 465 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-201ENST00000357436 NLRP3Q96P20 1036 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-201ENST00000357436 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A087WWV3 80 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-201ENST00000357436 NFIXQ14938 502 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-201ENST00000357436 LCORLQ8N3X6 602 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-201ENST00000357436 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1-201ENST00000357436 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.77■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TRDNQ13061 729 aa21.77■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 BECN2A8MW95 431 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF28PB7ZC32 967 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SPTLC2O15270 562 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 RAI14Q9P0K7 980 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 B4E1Z4 1266 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SDF4Q9BRK5 362 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TOMM22Q9NS69 142 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ZMYM6O95789 1325 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 NEDD4P46934 1319 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 EVX2Q03828 476 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 MYL10Q9BUA6 226 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K12Q12852 859 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ANO1Q5XXA6 986 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 LRP5O75197 1615 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP7A1P22680 504 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 NEMFO60524 1076 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ALX1Q15699 326 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 APOA5Q6Q788 366 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD7Q92527 254 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ARID3AQ99856 593 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CMA1P23946 247 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF202O95125 648 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM87BQ96K49 555 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 AIFM3Q96NN9 605 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ALG1Q9BT22 464 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-201ENST00000357436 CDKL5O76039 1030 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC39A14Q15043 492 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 NAPBQ9H115 298 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 DOCK2Q92608 1830 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC27P30260 824 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 TM4SF1P30408 202 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 ARID5BQ14865 1188 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF384Q8TF68 577 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 CHD4Q14839 1912 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 TDO2P48775 406 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 PROM2Q8N271 834 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 CNBD1Q8NA66 436 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 PRDX5P30044 214 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 NTRK3Q16288 839 aa21.69■■□□□ 1.06
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