RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 RIMBP2O15034 1052 aa28.51■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 BAG3O95817 575 aa28.51■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 SART3Q15020 963 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.51■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.51■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 SENP2Q9HC62 589 aa28.51■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa28.5■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.5■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 FGRP09769 529 aa28.5■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 SBK1Q52WX2 424 aa28.5■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 ESR2Q92731 530 aa28.5■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 CNPY2Q9Y2B0 182 aa28.5■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.49■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 GPT2Q8TD30 523 aa28.49■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 GDPD2Q9HCC8 539 aa28.49■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 H3BQV1 296 aa28.49■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 SMIM22K7EJ46 135 aa28.49■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 IFFO2Q5TF58 517 aa28.49■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 USP48Q86UV5 1035 aa28.49■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 CERS3Q8IU89 383 aa28.49■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 FERMT3Q86UX7 667 aa28.48■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa28.48■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 CPLX1O14810 134 aa28.47■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 MBD3O95983 291 aa28.47■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 EYA3Q99504 573 aa28.47■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 ERICH2A1L162 156 aa28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 ZBTB43O43298 467 aa28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 GTF2IP78347 998 aa28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 TMTC2Q8N394 836 aa28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 CNKSR1Q969H4 720 aa28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC69A6NI79 296 aa28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 NCLP19338 710 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 WTAPQ15007 396 aa28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 SLF2Q8IX21 1173 aa28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 SLC12A7Q9Y666 1083 aa28.46■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 CHRNA5P30532 468 aa28.45■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 USP5P45974 858 aa28.45■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 UBAC1Q9BSL1 405 aa28.45■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.15
SERF1A-202ENST00000354833 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa28.44■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa28.44■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 MICU3Q86XE3 530 aa28.44■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.44■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 LAMB1P07942 1786 aa28.44■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 BTDP43251 543 aa28.44■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 RESTQ13127 1097 aa28.44■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.44■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 NID2Q14112 1375 aa28.43■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 ORC4O43929 436 aa28.43■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 PPFIA3O75145 1194 aa28.43■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.43■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 GAKO14976 1311 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 GOLGA8AA7E2F4 631 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 FIBPO43427 364 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 CDKL5O76039 1030 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 RXRAP19793 462 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 ADD1P35611 737 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 KRT85P78386 507 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 CYP2D6P10635 497 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 CDC27P30260 824 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 SEC23AQ15436 765 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 DOK7Q18PE1 504 aa28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 TNKSO95271 1327 aa28.41■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L8P0C7I0 530 aa28.41■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 PLCG2P16885 1265 aa28.41■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 RCAN1P53805 252 aa28.41■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 EVX2Q03828 476 aa28.41■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 MYL10Q9BUA6 226 aa28.41■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 PRDM1O75626 825 aa28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 C12orf60Q5U649 245 aa28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 FAM173BQ6P4H8 233 aa28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 TCHHQ07283 1943 aa28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 SLX4Q8IY92 1834 aa28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 G3V3G9 751 aa28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 PDE4BQ07343 736 aa28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.4■■■□□ 2.14
SERF1A-202ENST00000354833 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms