RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.15□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 FOCADQ5VW36 1801 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 CERS5Q8N5B7 392 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TDO2P48775 406 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 SLF2Q8IX21 1173 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TMX3Q96JJ7 454 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 MXD3Q9BW11 206 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 VPS33BQ9H267 617 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 COL4A5P29400 1685 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 STRIP1Q5VSL9 837 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 SPON1Q9HCB6 807 aa7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 BAG3O95817 575 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 PPP4CP60510 307 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TMTC2Q8N394 836 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 USP17L3A6NCW0 530 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 USP17L4A6NCW7 530 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 BTDP43251 543 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 YDJCA8MPS7 323 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD1Q15327 319 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 DACT2Q5SW24 774 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 BANK1Q8NDB2 785 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 NCOA7Q8NI08 942 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TCEANC2Q96MN5 208 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.13□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 F8W031 263 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 PPARAQ07869 468 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 SEMA3FQ13275 785 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZUG5 572 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 CTR9Q6PD62 1173 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 BCS1LQ9Y276 419 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 NEDD4P46934 1319 aa7.12□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 LARGE1O95461 756 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 USP5P45974 858 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 SCNN1DP51172 638 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TRDNQ13061 729 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 AKNAD1Q5T1N1 836 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 WDR19Q8NEZ3 1342 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 MCM5P33992 734 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCR6-201ENST00000341935 INCENPQ9NQS7 918 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 MYH1P12882 1939 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 NFKBIEO00221 500 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 PRC1O43663 620 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 ANTXR2P58335 489 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 RHBDL3P58872 404 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 SBK1Q52WX2 424 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 CHST3Q7LGC8 479 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 NIM1KQ8IY84 436 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TEX11Q8IYF3 940 aa7.11□□□□□ -1.27
CCR6-201ENST00000341935 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.11□□□□□ -1.27
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